Tom Boonen heeft in het verleden kritische opmerkingen gemaakt over de rol van Wout van Aert binnen de Belgische wielerploeg. In augustus 2023 uitte Boonen zijn bedenkingen over de beslissing om zowel Van Aert als Jasper Philipsen mee te nemen naar het Wereldkampioenschap wielrennen. Hij stelde dat hij deze twee renners nooit samen zou selecteren vanwege hun vergelijkbare profielen, wat tot tactische complicaties zou kunnen leiden.
Eerder, in maart 2023, reageerde Boonen op Van Aerts uitspraak “Ik moet just niks” na zijn overwinning in de E3 Saxo Classic. Boonen benadrukte dat Van Aert juist wordt betaald om dergelijke koersen te winnen en dat dergelijke prestaties van hem worden verwacht.
Deze voorbeelden illustreren dat Boonen openlijk zijn mening deelt over Van Aerts rol en prestaties, soms met kritische kanttekeningen.
